Guías Docentes Electrónicas
1. DATOS GENERALES
Asignatura:
MARCADORES MOLECULARES
Código:
60616
Tipología:
OBLIGATORIA
Créditos ECTS:
6
Grado:
402 - GRADO EN BIOTECNOLOGÍA
Curso académico:
2021-22
Centro:
601 - E.T.S. INGENIEROS AGRONOMOS Y DE MONTES DE ALBACETE
Grupo(s):
10 
Curso:
2
Duración:
C2
Lengua principal de impartición:
Español
Segunda lengua:
Uso docente de otras lenguas:
English Friendly:
N
Página web:
Bilingüe:
N
Profesor: OUSSAMA AHRAZEM EL KADIRI - Grupo(s): 10 
Edificio/Despacho
Departamento
Teléfono
Correo electrónico
Horario de tutoría
ETSIAM/Genética
CIENCIA Y TECNOLOGÍA AGROFORESTAL Y GENÉTICA
8228
oussama.ahrazem@uclm.es
Solicitar previamente cita por e-mail

2. REQUISITOS PREVIOS

No se han establecido

3. JUSTIFICACIÓN EN EL PLAN DE ESTUDIOS, RELACIÓN CON OTRAS ASIGNATURAS Y CON LA PROFESIÓN

La asignatura de Marcadores Moleculares pretende aportar los fundamentos y competencias básicas que permiten a los alumnos, conocer las herramientas molecular que permite la identificación de las variaciones genéticas entre individuos. Los marcadores han tenido un impacto revolucionario en los estudios genéticos, la aplicación de los marcadores moleculares han contribuido en el avance en los estudios de la variabilidad genética, identificación de especies y cepas, relaciones filogenéticas y evolución y la construcción de mapas de ligamiento genético. las competencias tienen aplicaciones directas en áreas como la ecología, medicina forense, conservación de especies, tanto animales como vegetales, en evolución molecular, en los estudios poblacionales etc.. La adquisición de las competencias indicadas también permitirá a los alumnos diseñar estrategias en los estudios de mejora vegetal y animal.

La asignatura de Marcadores Moleculares  es fundamental para comprender la base experimental de los conceptos que se impartirán en otras asignaturas, particularmente la Mejora Genética Vegetal y Animal.

 

 


4. COMPETENCIAS DE LA TITULACIÓN QUE LA ASIGNATURA CONTRIBUYE A ALCANZAR
Competencias propias de la asignatura
Código Descripción
CB01 Que los estudiantes hayan demostrado poseer y comprender conocimientos en un área de estudio que parte de la base de la educación secundaria general, y se suele encontrar a un nivel que, si bien se apoya en libros de texto avanzados, incluye también algunos aspectos que implican conocimientos procedentes de la vanguardia de su campo de estudio
CB02 Que los estudiantes sepan aplicar sus conocimientos a su trabajo o vocación de una forma profesional y posean las competencias que suelen demostrarse por medio de la elaboración y defensa de argumentos y la resolución de problemas dentro de su área de estudio
CB03 Que los estudiantes tengan la capacidad de reunir e interpretar datos relevantes (normalmente dentro de su área de estudio) para emitir juicios que incluyan una reflexión sobre temas relevantes de índole social, científica o ética
CB04 Que los estudiantes puedan transmitir información, ideas, problemas y soluciones a un público tanto especializado como no especializado
CB05 Que los estudiantes hayan desarrollado aquellas habilidades de aprendizaje necesarias para emprender estudios posteriores con un alto grado de autonomía
CE05 Comprender las bases moleculares, celulares, fisiológicas, genéticas y de herencia génica que determinan la organización, funcionamiento e integración de los seres vivos y su interacción con el medio natural.
CE09 Aplicar y desarrollar metodologías derivadas de la biología molecular e ingeniería genética.
CG01 Capacidad de organización y planificación.
CG02 Capacidad de análisis y síntesis.
CG03 Capacidad para trabajar en equipos multidisciplinares de forma colaborativa y con responsabilidad compartida.
CG04 Sensibilidad hacia temas medioambientales.
CG05 Capacidad de aplicar los conocimientos en la práctica.
CT01 Conocer una segunda lengua extranjera.
CT02 Conocer y aplicar las Tecnologías de la Información y la Comunicación (TIC).
CT03 Utilizar una correcta comunicación oral y escrita.
CT04 Conocer el compromiso ético y la deontología profesional.
5. OBJETIVOS O RESULTADOS DE APRENDIZAJE ESPERADOS
Resultados de aprendizaje propios de la asignatura
Descripción
Interpretar los datos procedentes de observaciones y medidas en el laboratorio.
Adquirir las capacidades de utilización de las técnicas moleculares necesarias para el empleo de los marcadores en el estudio de problemas concretos.
Conocer las técnicas de purificación de los ácidos nucleicos
Conocer las técnicas moleculares necesarias para el desarrollo experimental de los distintos tipos de marcadores moleculares.
Desarrollar la capacidad de decidir entre métodos y diseñar protocolos de experimentación.
Realizar, presentar y defender informes científicos tanto de forma escrita como oral ante una audiencia.
Resultados adicionales
No se han establecido.
6. TEMARIO
  • Tema 1: UNIDAD 1. MARCADORES GENETICOS DE PRIMERA GENERACION
    • Tema 1.1: Técnicas y herramientas relacionadas con los marcadores de primera generación. Marcadores morfológicos. Marcadores basados en los polimorfismos de proteínas. Marcadores quimiotaxonómicos, basados en polisacáridos y metabolitos secundarios
    • Tema 1.2: Marcadores de DNA basados en restricción e hibridación: RFLPS y VNTRS
  • Tema 2: UNIDAD 2. MARCADORES GENÉTICOS DE SEGUNDA GENERACIÓN. BASADOS EN LA PCR
    • Tema 2.1: Técnicas y herramientas relacionadas con los marcadores de segunda generación
    • Tema 2.2: Código de barras (Barcode)
    • Tema 2.3: Técnicas que usan primers arbitrarios o semiarbitrarios. RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). DAF (DNA amplification fingerprinting). AP-PCR (Arbitrarily Primed-PCR). AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism). Ventajas e inconvenientes
    • Tema 2.4: Técnicas que usan la PCR con primers específicos. STS (Sequence Tagged Sites): PCR-RFLP o CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequence). PCR-Sequencing. STMs (Sequence-Tagged Microsatellites). SCAR (Sequence-Characterised Amplified Region). ISSRs (Inter-Simple Sequence Repeats). IRAP (Inter-retrotransposon amplified polymorphism). REMAP (Retrotransposon-microsatellite amplified polymorphism). Ventajas e inconvenientes
    • Tema 2.5: Marcadores basados en los retrotrasposones: S-SAP, IRAP, REMAP y RBIP
  • Tema 3: UNIDAD 3. MARCADORES GENÉTICOS DE TERCERA GENERACIÓN: DERIVADOS DE PROYECTOS DE SECUENCIACION, SNPs-INDELs
    • Tema 3.1: Técnicas y herramientas relacionadas con los marcadores de tercera generación. Una nueva generación de marcadores derivados de proyectos de secuenciación
  • Tema 4: UNIDAD 4. APLICACIONES DE LOS MARCADORES GENÉTICOS
    • Tema 4.1: Marcadores moleculares en bacterias y archeas: CRISPR
    • Tema 4.2: Marcadores moleculares y genética de poblaciones
  • Tema 5: PRÁCTICAS
    • Tema 5.1: Determinación del sexo por la prueba de la Amelogenina
    • Tema 5.2: Identificación de Hongos utilizando código de barras
    • Tema 5.3: Determinación de adulteraciones por PCR multiplex
    • Tema 5.4: Desarrollo de marcadores del ADN cloroplástico
    • Tema 5.5: Determinación de genotipos para los grupos ABO por PCR-RFLP
    • Tema 5.6: Isoenzimas: lactato deshidrogenasa
    • Tema 5.7: Identificación de hongos mediante código de barras
7. ACTIVIDADES O BLOQUES DE ACTIVIDAD Y METODOLOGÍA
Actividad formativa Metodología Competencias relacionadas ECTS Horas Ev Ob Descripción
Enseñanza presencial (Teoría) [PRESENCIAL] Método expositivo/Lección magistral 1 25 N N En las clases magistrales el profesor explicará los contenidos fundamentales de cada tema del programa y señalará las actividades asociadas al mismo.
Talleres o seminarios [PRESENCIAL] Seminarios 0.2 5 N N
Prácticas de laboratorio [PRESENCIAL] Prácticas 1 25 S N Todos los alumnos realizarán las prácticas de laboratorio correspondientes a la asignatura. La realización de las prácticas NO es recuperable. Al final del cuatrimestre se realizará una prueba de progreso de prácticas donde los alumnos deberán responder de forma individual a cuestiones relacionadas con las prácticas. La evaluación será recuperable.
Tutorías de grupo [PRESENCIAL] Otra metodología 0.1 2.5 N N
Elaboración de informes o trabajos [AUTÓNOMA] Trabajo en grupo 1 25 S N Se realizará un trabajo grupal relacionado con los marcadores moleculares
Estudio o preparación de pruebas [AUTÓNOMA] Otra metodología 2.6 65 N N
Pruebas de progreso [PRESENCIAL] Pruebas de evaluación 0.1 2.5 S N A mitad de semestre se realizará una prueba de evaluación liberatoria.
Total: 6 150
Créditos totales de trabajo presencial: 2.4 Horas totales de trabajo presencial: 60
Créditos totales de trabajo autónomo: 3.6 Horas totales de trabajo autónomo: 90

Ev: Actividad formativa evaluable
Ob: Actividad formativa de superación obligatoria (Será imprescindible su superación tanto en evaluación continua como no continua)

8. CRITERIOS DE EVALUACIÓN Y VALORACIONES
Sistema de evaluación Evaluacion continua Evaluación no continua * Descripción
Trabajo 10.00% 0.00% Se valorará la realización de trabajos, casos prácticos y/o
problemas.
Realización de prácticas en laboratorio 20.00% 20.00% A final de curso se realizará una prueba de prácticas. Los alumnos que superen esta prueba con 4/10, tendrán la parte de las prácticas aprobada, y se les guardará la nota para la convocatoria ordinaria y extraordinaria.
Pruebas de progreso 35.00% 0.00% Se realizará una prueba escrita a mitad de curso. Los alumnos que superen esta prueba (4/10) liberarán materia y en la convocatoria ordinaria podrán ser evaluados únicamente de la parte no evaluada en la prueba de progreso parcial. Se exigirá una nota mínima de 4 puntos sobre 10 para considerar superada esta prueba. Los alumnos que han obtenido una nota inferior a 4/10 no se le conservará la nota ni en la convocatoria ordinaria ni extraordinaria.
Pruebas de progreso 35.00% 0.00% En caso de haber superado la prueba de progreso (4/10), los alumnos podrán examinarse en la prueba final únicamente de la parte no evaluada. Se realizará la media entre ambas pruebas. - En caso de no haber superado o examinado de la prueba de progreso, la nota de esta prueba no se guarda y los alumnos tendrán que examinarse en la prueba final de todo el contenido de la asignatura, En este caso, la prueba final (convocatoria ordinaria) supondrá el 70% de la nota en el caso de la evaluación continua y 80% en la evaluación no continua.
La nota mínima para poder hacer media ponderada en todos los bloques será de un 4. La asignatura se supera si al aplicar la media ponderada de los diferentes bloques el resultado es mayor a igual a un 5,00. Para superar a asignatura en la modalidad continua, los bloques serán teoría (70%), prácticas (20%) y trabajo (10%).
Prueba final 0.00% 80.00% En caso de haber superado la prueba de progreso (4/10), los alumnos podrán examinarse en la prueba final únicamente de la parte no evaluada. Se realizará la media entre ambas pruebas. - En caso de no haber superado o examinado de la prueba de progreso, la nota de esta prueba no se guarda y los alumnos tendrán que examinarse en la prueba final de todo el contenido de la asignatura, En este caso, la prueba final (convocatoria ordinaria) supondrá el 70% de la nota en el caso de la evaluación continua y 80% en la evaluación no continua.
La nota mínima para poder hacer media ponderada en todos los bloques será de un 4. La asignatura se supera si al aplicar la media ponderada de los diferentes bloques el resultado es mayor a igual a un 5,00. Para superar a asignatura en la modalidad continua, los bloques serán teoría (80%) y prácticas (20%) .
Total: 100.00% 100.00%  
* En Evaluación no continua se deben definir los porcentajes de evaluación según lo dispuesto en el art. 6 del Reglamento de Evaluación del Estudiante de la UCLM, que establece que debe facilitarse a los estudiantes que no puedan asistir regularmente a las actividades formativas presenciales la superación de la asignatura, teniendo derecho (art. 13.2) a ser calificado globalmente, en 2 convocatorias anuales por asignatura, una ordinaria y otra extraordinaria (evaluándose el 100% de las competencias).

Criterios de evaluación de la convocatoria ordinaria:
  • Evaluación continua:
    Con respecto al bloque de teoría, el estudiante que elige la evaluación continua (70% teoría) podrá realizar una prueba escrita a mitad de curso donde se examinará de la mitad de los contenidos teóricos. El estudiante que elija esta opción se presentará a la convocatoria ordinaria para ser evaluado de la otra mitad. La nota obtenida en teoría será la nota media aritmética de ambas partes. En el caso de ir directamente al ordinario, el estudiante será evaluado del 100% de los contenidos teóricos. Para poder optar a realizar la prueba de progreso, el estudiante deberá rellenar el formulario que será publicado en tiempo y forma a través del foro del campus virtual. No se atenderán solicitudes para llevar a cabo la prueba de progreso por correo electrónico.
    Con respecto al bloque de prácticas, el estudiante que elige la evaluación continua (20% prácticas) será evaluado con un 10% por la participación durante el desarrollo de las prácticas en el laboratorio de todas las sesiones y con un 90% a través de una prueba procedimental tipo test / desarrollo etc que se llevará a cabo en la sesión de la prueba ordinaria. El alumno que asiste y lleva a cabo satisfactoriamente las prácticas (10% participación) no tendrán que repetirlas en años consecutivos y solo tendrá que presentarse al examen procedimental en años sucesivos si la media ponderada entre la participación y la prueba procedimental da como resultado un valor menor a 4.
    La nota mínima para poder hacer media ponderada en todos los bloques será de un 4. La asignatura se supera si al aplicar la media ponderada de los diferentes bloques el resultado es mayor a igual a un 5,00. Para superar a asignatura en la modalidad continua, los bloques serán teoría (70%), prácticas (20%) y trabajo (10%).
    Los contenidos y/o apartados concretos de esta guía podrán ser objeto de modificaciones si la situación sociosanitaria debida a la pandemia o por fuerza mayor lo exige. En cualquier caso los estudiantes serán advertidos de dichos cambios a través de campus virtual.
    En el momento de publicación de la guía e se están considerando todas las posibilidades de docencia (presencial, semipresencial y/u on line) que se llevarán a efecto en función de la evolución de la situación sanitaria.
  • Evaluación no continua:
    Con respecto al bloque de teoría, el estudiante que elige la evaluación NO continua (80% teoría) se presentará a la convocatoria ordinaria para ser evaluado del 100% de los contenidos teóricos.
    Con respecto al bloque de prácticas, el estudiante que elige la evaluación NO continua (20% prácticas) será evaluado con una prueba de laboratorio y una prueba procedimental tipo test / desarrollo etc que se llevará a cabo el día de la prueba ordinaria.
    En esta modalidad, no se guardan las notas de prácticas para años posteriores.
    La nota mínima para poder hacer media ponderada en todos los bloques será de un 4. La asignatura se supera si al aplicar la media ponderada de las diferentes bloques el resultado es mayor a igual a un 5,00. Para superar a asignatura en la modalidad NO continua, los bloques serán teoría (80%) y prácticas (20%).
    Los contenidos y/o apartados concretos de esta guía podrán ser objeto de modificaciones si la situación sociosanitaria debida a la pandemia o por fuerza mayor lo exige. En cualquier caso los estudiantes serán advertidos de dichos cambios a través de campus virtual.
    En el momento de publicación de la guía e se están considerando todas las posibilidades de docencia (presencial, semipresencial y/u on line) que se llevarán a efecto en función de la evolución de la situación sanitaria.

Particularidades de la convocatoria extraordinaria:
Con respecto al bloque de teoría, el estudiante que elige la evaluación continua (70% teoría) el estudiante será evaluado del 100% de los contenidos teóricos y NO se guardará la nota obtenido en la prueba de progreso.
Con respecto al bloque de prácticas, el estudiante que elige la evaluación continua (20% prácticas) será evaluado con un 10% por la participación durante el desarrollo de las prácticas en el laboratorio de todas las sesiones y con un 90% a través de una prueba procedimental tipo test / desarrollo etc que se llevará a cabo en la sesión de la prueba extraordinaria SI la nota media entre la participación (10%) y la prueba procedimental (90%) es menor a 4. El alumno que asiste y lleva a cabo satisfactoriamente las prácticas (10% participación) no tendrán que repetirlas en años consecutivos y solo tendrá que presentarse al examen procedimental en años sucesivos si la media ponderada entre la participación y la prueba procedimental da como resultado un valor menor a 4.
La nota mínima para poder hacer media ponderada en todos los bloques será de un 4. La asignatura se supera si al aplicar la media ponderada de las diferentes bloques el resultado es mayor a igual a un 5,00. Para superar a asignatura en la modalidad continua, los bloques serán teoría (70%), prácticas (20%) y trabajo (10%).
Los contenidos y/o apartados concretos de esta guía podrán ser objeto de modificaciones si la situación sociosanitaria debida a la pandemia o por fuerza mayor lo exige. En cualquier caso los estudiantes serán advertidos de dichos cambios a través de campus virtual.
En el momento de publicación de la guía e se están considerando todas las posibilidades de docencia (presencial, semipresencial y/u on line) que se llevarán a efecto en función de la evolución de la situación sanitaria.
En cualquier caso los estudiantes serán advertidas de dichos cambios a través de campus virtual.
Particularidades de la convocatoria especial de finalización:
Para superar esta convocatoria se tendrán los mismos requisitos que la evaluación NO continua en la convocatoria ordinaria.
9. SECUENCIA DE TRABAJO, CALENDARIO, HITOS IMPORTANTES E INVERSIÓN TEMPORAL
No asignables a temas
Horas Suma horas

Tema 1 (de 5): UNIDAD 1. MARCADORES GENETICOS DE PRIMERA GENERACION
Grupo 10:
Inicio del tema: 02-02-2021 Fin del tema: 11-02-2021

Tema 2 (de 5): UNIDAD 2. MARCADORES GENÉTICOS DE SEGUNDA GENERACIÓN. BASADOS EN LA PCR
Grupo 10:
Inicio del tema: 25-02-2021 Fin del tema: 01-03-2021

Tema 3 (de 5): UNIDAD 3. MARCADORES GENÉTICOS DE TERCERA GENERACIÓN: DERIVADOS DE PROYECTOS DE SECUENCIACION, SNPs-INDELs
Grupo 10:
Inicio del tema: 06-04-2021 Fin del tema: 16-04-2021

Tema 4 (de 5): UNIDAD 4. APLICACIONES DE LOS MARCADORES GENÉTICOS
Grupo 10:
Inicio del tema: 27-04-2021 Fin del tema: 29-04-2021

Tema 5 (de 5): PRÁCTICAS
Grupo 10:
Inicio del tema: 22-02-2021 Fin del tema: 21-05-2021

Comentarios generales sobre la planificación: La planificación se encuentra en la plataforma Moodle. Dicha planificación es temporal y podrá verse modificada ante causas imprevistas
10. BIBLIOGRAFÍA, RECURSOS
Autor/es Título Libro/Revista Población Editorial ISBN Año Descripción Enlace Web Catálogo biblioteca
Avise JC Molecular Markers, Natural History and Evolution, 2nd edition Sinauer Associates 978-1-4615-2381-9 2004  



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