Guías Docentes Electrónicas
1. DATOS GENERALES
Asignatura:
BIOLOGÍA MOLECULAR DE SISTEMAS Y BIOINFORMÁTICA
Código:
13327
Tipología:
OBLIGATORIA
Créditos ECTS:
6
Grado:
341 - GRADO EN BIOQUÍMICA
Curso académico:
2021-22
Centro:
501 - FACULTAD DE CC. AMBIENTALES Y BIOQUÍMICA (TO)
Grupo(s):
40 
Curso:
3
Duración:
C2
Lengua principal de impartición:
Español
Segunda lengua:
Inglés
Uso docente de otras lenguas:
English Friendly:
N
Página web:
Bilingüe:
N
Profesor: RAUL CALERO OLIVER - Grupo(s): 40 
Edificio/Despacho
Departamento
Teléfono
Correo electrónico
Horario de tutoría
ICAM/Despacho 31
QUÍMICA INORG., ORG., Y BIOQ.
5440
Raul.Calero@uclm.es
martes y jueves de 10 a 14 h previa cita por e-mail.

Profesor: CAROLINA ESCOBAR LUCAS - Grupo(s): 40 
Edificio/Despacho
Departamento
Teléfono
Correo electrónico
Horario de tutoría
Sabatini/029
CIENCIAS AMBIENTALES
5476
carolina.escobar@uclm.es
previa cita por mail. Lunes y jueves de 14:00 a 15:00

Profesor: BOYKO YUDA KOEN --- - Grupo(s): 40 
Edificio/Despacho
Departamento
Teléfono
Correo electrónico
Horario de tutoría
INAMOL, despacho 1.4
QUÍMICA FÍSICA
5571
boyko.koen@uclm.es
previa cita por e-mail.

Profesor: Mª DEL MAR MARTIN TRILLO - Grupo(s): 40 
Edificio/Despacho
Departamento
Teléfono
Correo electrónico
Horario de tutoría
ICAM/0.20
CIENCIAS AMBIENTALES
5782
mariamar.martin@uclm.es
previa cita por e-mail

Profesor: Mª DE LA MONTAÑA MENA MARUGAN - Grupo(s): 40 
Edificio/Despacho
Departamento
Teléfono
Correo electrónico
Horario de tutoría
Sabatini/029
CIENCIAS AMBIENTALES
5434
montana.mena@uclm.es
Lunes, miércoles y jueves de 12 a 14 h previa cita por e-mail.

2. REQUISITOS PREVIOS

No se han establecido requisitos para cursar la asignatura.

3. JUSTIFICACIÓN EN EL PLAN DE ESTUDIOS, RELACIÓN CON OTRAS ASIGNATURAS Y CON LA PROFESIÓN

Se trata de una asignatura obligatoria que pertenece a la materia de "Metodologías Instrumentales" en el módulo de "Métodos Bioquímicos y Biología Molecular de Sistemas".

Los recientes avances de las tecnologías de alto rendimiento en biología molecular suministran ingentes cantidades de datos en diversos organismos modelo, que se manejan con técnicas bioinformáticas. La Biología Molecular de Sistemas aborda el análisis de estas colecciones exhaustivas de datos y su integración en redes globales (las ómicas) para suministrar nuevas interpretaciones y formular hipótesis sobre los sistemas biológicos. Por lo tanto, la asignatura aporta las herramientas para el análisis, la integración y la interpretación de datos moleculares globales y la construcción de modelos interpretativos de los procesos y sistemas biológicos.

La asignatura requiere los conocimientos aportados previamente por las diversas materias relacionadas con la biología molecular y la biología funcional de organismos, Ingeniería Genética y bioestadística y Metodología e instrumentación bioquímicas. Las competencias que se desarollarán en la asignatura son de aplicación obligada en los dos intinerarios de especialización (Biotecnológico y Biosanitario) y serán de gran utilidad en el desarollo de los Trabajos Fin de Grado en todas las temáticas relacionadas con la Biología Molecular. 

En términos profesionales, la Biología Molecular de Sistemas y Bioinformática provee de una visión integradora de las ciencias biomoleculares y unas herramientas metodológicas indispensables para un bioquímico en cualquier sector de investigación, enseñanza, productivo o de servicios, ya que las ómicas serán cada vez más empleadas para la innovación en los sectores de la agroalimentación, sanidad, medioambiente e industria.


4. COMPETENCIAS DE LA TITULACIÓN QUE LA ASIGNATURA CONTRIBUYE A ALCANZAR
Competencias propias de la asignatura
Código Descripción
E01 Expresarse correctamente con términos biológicos, físicos, químicos matemáticos e informáticos básicos.
E04 Conocer los principios y aplicaciones de los métodos e instrumentación utilizados en las determinaciones bioanalíticas.
E12 Poseer las habilidades numéricas y de cálculo que permitan aplicar procedimientos matemáticos para el análisis de datos.
E13 Manejar correctamente distintas herramientas informáticas para realizar cálculos numéricos, análisis de errores y estadísticos y representar los datos experimentales.
E17 Conocer los fundamentos y aplicaciones de las tecnologías ómicas genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica, etc; y saber utilizar las herramientas informáticas básicas y las bases de datos más usuales relacionadas con estas tecnologías
G01 Poseer y comprender los conocimientos en el área de Bioquímica y Biología Molecular a un nivel que, apoyándose en los libros de texto avanzados, incluya también aspectos de vanguardia de relevancia en la disciplina.
G02 Saber aplicar los conocimientos de Bioquímica y Biología Molecular a la práctica profesional y poseer las competencias y habilidades intelectuales necesarias para dicha práctica, incluyendo capacidad de gestión de la información, análisis y síntesis, resolución de problemas, organización y planificación y generación de nuevas ideas.
G03 Ser capaces de reunir e interpretar datos, información y resultados relevantes, obtener conclusiones y emitir informes razonados en temas relevantes de índole social, científica o ética en conexión con los avances en Bioquímica y Biología Molecular.
G06 Adquirir habilidades en el manejo de programas informáticos incluyendo el acceso a bases de datos bibliográficas, estructurales o de cualquier otro tipo útiles en Bioquímica y Biología Molecular.
T01 Dominio de una segunda lengua extranjera, preferiblemente el inglés, en el nivel B1 del Marco Común Europeo de Referencia para las Lenguas.
T02 Conocimiento a nivel de usuario de las Tecnologías de la Información y la Comunicación (TIC).
T03 Una correcta comunicación oral y escrita.
T05 Capacidad de organización y planificación.
T06 Capacidad de diseño, análisis y síntesis.
T08 Capacidad para trabajar en equipo y, en su caso, ejercer funciones de liderazgo, fomentando el carácter emprendedor.
T10 Capacidad de autoaprendizaje y de obtener y gestionar información bibliográfica, incluyendo recursos en Internet.
5. OBJETIVOS O RESULTADOS DE APRENDIZAJE ESPERADOS
Resultados de aprendizaje propios de la asignatura
Descripción
Desarrollar la capacidad de integrar el elevado volumen y la diversidad de información molecular obtenidos con tecnologías ¿ómicas¿, aplicar planteamientos sistémicos para su análisis e interpretar los procesos biológicos complejos subyacentes.
Ser capaz de analizar, interpretar y obtener conclusiones a partir de datos experimentales.
Conocer y ejercitar las principales herramientas bioinformáticas de manejo, análisis, predicción y modelado de datos biológicos derivados de estudios ¿ómicos¿ estructurales y funcionales.
Entender correctamente el funcionamiento de las instrumentación básica utilizada en la investigación bioquímica
Conocer y comprender las bases conceptuales de las tecnologías de alto rendimiento para la determinación de la secuencia de genomas, el estudio de la expresión génica global, la caracterización del proteoma, sus modificaciones postraduccionales y el análisis de rutas metabólicas.
Adquirir las habilidades necesarias para el uso de técnicas relevantes en bioquímica.
Resultados adicionales
No se han establecido.
6. TEMARIO
  • Tema 1: Genómica I: Interpretación y análisis bioinformático de la secuencia de genomas y sus aplicaciones
    • Tema 1.1: Secuenciación de genomas y Proyectos Genoma. Aplicaciones en Biotecnología y Biomedicina
    • Tema 1.2: Bases de datos y análisis bioinformático de secuencias biológicas.
    • Tema 1.3: Prácticas en Genómica I
  • Tema 2: Genómica II: Genómica funcional y aplicaciones
    • Tema 2.1: Transcriptómica: Microordenamientos de DNA. Obtención, análisis e interpretación de perfiles globales de expresión génica.
    • Tema 2.2: Genómica funcional a partir del transcriptoma mediante microordenamientos
    • Tema 2.3: Aplicaciones de la transcriptómica mediante microordenamientos.
  • Tema 3: Proteómica
    • Tema 3.1: Proteómica estructural.
    • Tema 3.2: Métodos de separación e identificación de proteínas.
    • Tema 3.3: Análisis diferencial y comparación de proteomas.
    • Tema 3.4: Interacciones proteína-proteína. Mapas de interacciones.
    • Tema 3.5: Prácticas en Proteómica
  • Tema 4: Metabolómica y lipidómica
    • Tema 4.1: Introducción a la metabolómica.
    • Tema 4.2: Aproximaciones metabolómicas.
    • Tema 4.3: Diseño del estudio y recolección de muestras.
    • Tema 4.4: Técnicas de análisis utilizadas en metabolómica.
    • Tema 4.5: Modelado y análisis de datos en metabolómica.
    • Tema 4.6: Aplicaciones Metabolómicas en Biomedicina: Biomarcadores
    • Tema 4.7: Lipidómica. Obtención y separación de lípidos. Identificación y cuantificación de lípidos celulares.
7. ACTIVIDADES O BLOQUES DE ACTIVIDAD Y METODOLOGÍA
Actividad formativa Metodología Competencias relacionadas ECTS Horas Ev Ob Descripción
Enseñanza presencial (Teoría) [PRESENCIAL] Método expositivo/Lección magistral E01 E04 E17 T01 T03 1.56 39 N N Clases magistrales en las que se desarrollarán los contenidos teóricos. Las clases magistrales estarán a disposición del estudiante en Moodle.
Prácticas en aulas de ordenadores [PRESENCIAL] Trabajo dirigido o tutorizado E01 E12 E13 E17 G06 T01 T02 T10 0.6 15 S S Se llevaran a cabo sesiones prácticas dirigidas por los profesores de la asignatura, correspondientes a los diferentes bloques temáticos. La realización de las prácticas es obligatoria y no recuperable. Solo podrán ser evaluados aquellos alumnos que hayan realizado las practicas.
Elaboración de informes o trabajos [AUTÓNOMA] Combinación de métodos E12 E13 E17 G02 G03 G06 T01 T02 T06 0.4 10 S N Resolución de forma autónoma de problemas y seminarios relacionados con la metabolómica/lipidómica. Esta actividad no es recuperable.
Otra actividad presencial [PRESENCIAL] Pruebas de evaluación 0.04 1 S S Se realizará una prueba escrita de los contenidos de las prácticas de genómica y proteómica. Solo podrán ser evaluados aquellos alumnos que hayan realizado las practicas. La evaluación será recuperable, ya sea en la convocatoria extraordinaria o especial de finalización.
Talleres o seminarios [PRESENCIAL] Trabajo autónomo E01 E17 G03 T01 T02 T03 T05 T08 T10 0.08 2 S N Se realizará un seminario sobre temas relacionados con la proteómica. Esta actividad no es recuperable.
Estudio o preparación de pruebas [AUTÓNOMA] Trabajo autónomo E12 E13 E17 G01 G02 G06 T02 T05 3.2 80 N N Autoaprendizaje
Prueba final [PRESENCIAL] Pruebas de evaluación E01 E17 G06 T03 T10 0.12 3 S S La prueba final constará de un examen global de los tres bloques temáticos de la asignatura: genómica, proteómica y metabolómica/lipidómica.
Total: 6 150
Créditos totales de trabajo presencial: 2.4 Horas totales de trabajo presencial: 60
Créditos totales de trabajo autónomo: 3.6 Horas totales de trabajo autónomo: 90

Ev: Actividad formativa evaluable
Ob: Actividad formativa de superación obligatoria (Será imprescindible su superación tanto en evaluación continua como no continua)

8. CRITERIOS DE EVALUACIÓN Y VALORACIONES
Sistema de evaluación Evaluacion continua Evaluación no continua * Descripción
Prueba 14.00% 14.00% Se realizará una prueba escrita de los contenidos de las prácticas de genómica (8%) y proteómica (6%). Solo podrán ser evaluados aquellos alumnos que hayan realizado las practicas. La evaluación de las mismas será recuperable, ya sea en la convocatoria extraordinaria o especial de finalización. Se requiere una nota mínima de 4 sobre 10 para calcular la media ponderada con el resto de actividades.
Otro sistema de evaluación 4.00% 0.00% Se evaluará la respuesta a cuestiones planteadas por los profesores de proteómica y metabolómica/lipidómica acerca de resolución de problemas o publicaciones científicas propuestas en los seminarios correspondientes a estos bloques temáticos. Esta actividad no es recuperable.
Prueba final 74.00% 78.00% La prueba final consistirá en un examen global de los tres bloques temáticos que componen la asignatura: genómica, proteómica y metabolómica/lipidómica.
Se requiere una nota mínima de 4 sobre 10 para calcular la media ponderada con el resto de las actividades. Será necesario obtener una nota final de al menos 5 (sobre 10) para aprobar la asignatura.
Práctico 8.00% 8.00% Resolución de un caso práctico on-line durante las prácticas de metabolómica y lipidómica. Esta actividad no es recuperable.
Total: 100.00% 100.00%  
* En Evaluación no continua se deben definir los porcentajes de evaluación según lo dispuesto en el art. 6 del Reglamento de Evaluación del Estudiante de la UCLM, que establece que debe facilitarse a los estudiantes que no puedan asistir regularmente a las actividades formativas presenciales la superación de la asignatura, teniendo derecho (art. 13.2) a ser calificado globalmente, en 2 convocatorias anuales por asignatura, una ordinaria y otra extraordinaria (evaluándose el 100% de las competencias).

Criterios de evaluación de la convocatoria ordinaria:
  • Evaluación continua:
    Se asumirá la participación en la modalidad de evaluación continua si el estudiante no comunica lo contrario, por escrito, a todos los profesores de la asignatura.
    La asistencia a prácticas es obligatoria y será requisito indispensable para superar la asignatura. Se exigirá una nota mínima de 4 sobre 10 en el examen final y en la prueba de practicas (genómica y proteómica) para calcular la media ponderada de estas calificaciones y contabilizar el resto de las actividades. La calificación final de la asignatura se calculará teniendo en cuenta los porcentajes de la tabla anterior. Para aprobar la asignatura la calificación global deberá ser igual o superior a 5 sobre 10.
  • Evaluación no continua:
    La asistencia a prácticas es obligatoria y será requisito indispensable para superar la asignatura. Se exigirá una nota mínima de 4 sobre 10 en el examen final y en la prueba de practicas (genómica y proteómica) para calcular la media ponderada de estas calificaciones y contabilizar el caso práctico de metabolómica/lipidómica. La calificación final de la asignatura se calculará teniendo en cuenta los porcentajes de la tabla anterior. Se exigirá una nota final de 5 sobre 10 para superar la asignatura.

Particularidades de la convocatoria extraordinaria:
Para la convocatoria extraordinaria se tendrán en cuanta las calificaciones de las actividades no recuperables realizadas a lo largo del curso. Se exigirá un 4 sobre 10 para conservar la nota de la convocatoria ordinaria en el examen final o en la prueba de prácticas.
Además, se requiere una nota mínima de 4 sobre 10 en el examen global de los tres bloques temáticos y en la prueba de practicas (genómica y proteómica) para calcular la media ponderada de estas calificaciones y contabilizar el resto de las actividades. La calificación final de la asignatura se calculará teniendo en cuenta los porcentajes de la tabla anterior. Se exigirá una nota final de 5 sobre 10 para superar la asignatura.
Particularidades de la convocatoria especial de finalización:
En esta convocatoria sólo habrá una prueba final que supondrá el 100 % de la nota, en la que cada bloque temático representará un tercio de la calificación final. La asistencia a prácticas es obligatoria y será requisito indispensable para superar la asignatura. La asignatura se superará con un 5 sobre 10.
9. SECUENCIA DE TRABAJO, CALENDARIO, HITOS IMPORTANTES E INVERSIÓN TEMPORAL
No asignables a temas
Horas Suma horas

10. BIBLIOGRAFÍA, RECURSOS
Autor/es Título Libro/Revista Población Editorial ISBN Año Descripción Enlace Web Catálogo biblioteca
A. Malcolm Campbell, Laurie J. Heyer Discovering Genomics, Proteomics and Bioinformatics CSHL Press 978-0805382198 2007  
Eberhard O. Voit A first course of system biology. Garland science 9780815344674 2012  
Greb Gibson and Spencer V Muse A Primer of Genome Science, Third Edition Sinauer Associates, Inc 0878932364 2009  
Jonathan Pevsner Bioinformatics and Functional Genomics Wiley-Blackwell 978-0470085851 2009  
Marketa Zvelebil, Jeremy O. Baum Understanding Bioinformatics Garland Science 978-0-8153-4024-9 2008 Ficha de la biblioteca
R. M. Twyman Principles of Proteomics Taylor and Francis 1-85996-273-4 2004 Ficha de la biblioteca
S. B. Primrose, R. Twyman Principles of Gene Manipulation and Genomics, 7th Edition Wiley-Blackwell ISBN 978-1-4051-3544 2006  



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